Испанскую синагогу построили в 1868—93 годах на месте молитвенного дома, известного как Старая школа. Он был самой старой синагогой в еврейском квартале Праги и упоминался в письменных источниках еще в середине XII века, но к XIX столетию здание, возведенное в готическом стиле, выглядело очень плохо и буквально разваливалось на глазах.
Проект Испанской синагоги разработали Войтех Игнац Ульман и Йозеф Никлас. Они выбрали неомавританский стиль, благодаря которому здание издалека бросается в глаза. Возможно, на выбор архитекторов повлияло то, что в Старой школе еще в XVI веке жила группа евреев-сефардов, бежавших из Испании, где в то время свирепствовала инквизиция. Но если гиды будут рассказывать, что спроектированный Ульманом и Никласом молитвенный дом использовался сефардской общиной — не верьте. Это выдумки.
Синагога выглядит несколько эклектично. В ней есть что-то от мечети, а что-то — от католического храма. Интерьер напоминает о знаменитой испанской Альгамбре, в нем большую роль играют растительные и геометрические орнаменты, характерные для исламской архитектуры.