Управление ОЭЗ осуществляют:
1. Министерство экономического развития РФ (далее – Минэкономразвития России)354, за исключением 5 ОЭЗ, созданных на территории Северо-Кавказского федерального округа, которые управляются Министерством РФ по делам Северного Кавказа (далее – Минкавказ России)355.
2. Наблюдательный совет.
3. Управляющая компания356. В настоящее время каждая ОЭЗ управляется отдельным хозяйственным обществом357, в то время как АО «Особые экономические зоны» координирует управление всеми ОЭЗ.
