Ежедневно требуется выливать из увлажнителя вчерашнюю воду и насухо протирать чистой сухой тряпкой все контактирующие с водой поверхности. А каждый третий день нужно устраивать увлажнителю хорошую чистку, мыть его горячей водой с моющим средством и хорошо оттирать отложения губкой или тряпкой.
Каждые несколько дней нужно увлажнитель дезинфицировать. В официальных рекомендациях предлагают это делать путем оттирания отложений 3 %-й перекисью водорода. Некоторые производители предлагают обрабатывать увлажнитель домашней хлоркой. Та содержит 5–8 % гипохлорита натрия. Одну чайную ложку такого средства разводят в 4 литрах воды и заливают в бачок увлажнителя на час. Потом хорошо прополаскивают.