Смутного времени показали, насколько важен Троице-Сергиев монастырь для обороны Москвы. В 40-е годы XVII века крепостную стену вдвое увеличили по высоте и ширине. И теперь это единственная крепость с двумя рядами навесных бойниц – машикулей. Надстроили и все монастырские башни.