Чтобы скопировать файл в Kali, вы должны использовать команду cp вот так:
$ cp [путь к исходному файлу] [путь файла назначения]
root@kali:~# cp test.txt /home/kali
root@kali:~# ls /home/kali
Desktop Downloads Music Public test.sh Videos
Documents ls_file.txt Pictures Templates test.txt