По мере того, как воспаление распространяется апикально, происходит дальнейшее разрушение коллагеновых волокон периодонтальной связки и резорбция альвеолярной кости. Данные процессы являются частью защитного механизма, при котором защитные клетки мигрируют в область воспаления для борьбы с бактериальной инфекцией. Происходит разрушение тканей, чтобы создать пространство в периодонте для размещения защитных клеток. По мере разрушения эпителия соединительный эпителий отрастает в более апикальном месте, и формируется карман, выстланный изъязвленным, гиперплазированным эпителием. Затем бактерии зубного налета мигрируют апикально вдоль поверхности корня в карман, где физические условия позволяют размножаться грамотрицательным анаэробным видам. К сожалению, защитных