После кончины Ивана Грозного царский трон занимает Борис Годунов. Стремясь привести Россию к благоденствию, он идёт к своей власти напролом, убивая сына Ивана Грозного. Ставши царем, Борис чувствует себя несчастным. Несмотря на позитивные преобразования России, царь не получает всенародной любви.
В этот же период появляется самозванец Гришка Отрепьев. Стремясь сделать свою жизнь незаурядной и яркой, он объявляет себя царевичем Дмитрием, чудом выжившим после расправы.
Повесть заканчивается смертью Годунова и приходом к власти Самозванца.
Так же Годунов является причиной смерти собственных детей.