Евгений Спангенберг родился в 1898 году на ст. Андриановка Читинской области. Позже Спангенберги переехали из Петербурга в небольшой железнодорожный поселок Ахтубу в степях Нижнего Поволжья. У дома был большой сад, а рядом - степь, где встречалось множество птиц (например, прямо в саду Евгений однажды поймал вальдшнепа). Все это стимулировало интерес Евгения Спангенберга к природе. Немало способствовал росту этого интереса и отец, увлекавшийся охотой. В 1922 году Евгений Спангенберг поступил в Московский университет на естественное отделение физико-математического факультета, который закончил в 1930. В 1931 г. Евгений Павлович стал старшим научным сотрудником ВНИИ охотничьего хозяйства, звероводства и оленеводства. В 1944 году он стал доцентом биологического факультета Московского университета, в 1945 году ему присвоили ученую степень кандидата биологических наук. С 1946 г. Евгений Спангенберг работает в Зоологическом музее МГУ, сначала - заведующим герпетологическим отделом, а позже, в 1950 году - в орнитологическом отделе. Здесь он стал старшим научным сотрудником, проработав 18 лет, до конца жизни. С 1924 г. до конца 1950-х активно участвовал в экспедициях. Первая его экспедиция была в Среднюю Азию, в края нижнего течения Сырдарьи. Изучением этих районов Спангенберг занимался следующие четыре года. Позже он работал в пустыне Каракумы, на побережье Аральского моря. Неоднократно возвращался в Южный Казахстан, работал в пустыне Кызылкум. Наблюдения, полученные в результате девятилетний исследований, легли в основу монографии, посвященной описанию птиц Нижней Сырдарьи и близлежащих районов. Параллельно с этой работой, Спангенберг провел цикл экспедиций в Закавказье. По результатам этой работы была опубликована книга «Животный мир Азербайджана», которая и сейчас остается наиболее полной работой по азербайджанским птицам. Евгений Спангенберг также работал в заповеднике "Семь островов", Оренбургской области, Киргизии, на озере Сарычелек в Фергане. После войны, в 1946 г. работает в Туркмении. Много раз посещал Крым.
